《表2 ISSR-PCR扩增正交设计方差分析》

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《椭圆叶花锚ISSR-PCR体系的建立与优化》


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根据电泳评分数据,利用极差分析方法得到正交设计的极差值(表1)。各水平的Kl计算各因素同一水平指标的平均值Ki,Ki越大,说明扩增效果越好;同时,求出每个因素在不同水平的极差值R,R值越大则该因素对ISSR-PCR扩增体系的影响越大。通过实验发现,DNA浓度的R值最大,即对花锚ISSR-PCR反应影响最大,各因素影响大小依次是:DNA浓度>Mg2+>dNTPs>Taq DNA酶>引物(表1)。为进一步判断各因素对花锚ISSR-PCR的影响程度,采用方差分析进行检验,结果表明DNA浓度、dNTPs、Taq DNA酶和Mg2+对ISSR-PCR的影响达到显著水平(p<0.05)(表2),而引物浓度差异不显著(p>0.05)。根据方差分析的F值可知,DNA浓度对ISSR-PCR反应体系的影响作用最大,各因素影响大小依次为:DNA浓度>Mg2+>d NTPs>Taq DNA酶>引物,与极差分析结果完全一致。