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第1篇 概论1

第一章 细菌分类及命名1

第一节 概述1

一、细菌分类学与临床1

二、细菌分类学对临床工作的指导意义1

第二节 细菌分类学基础4

一、细菌分类学的依据和方法4

二、细菌分类单位和命名6

第三节 伯杰细菌分类系统7

一、临床常见需氧及兼性厌氧致病细菌分类8

三、与临床有关的致病性真菌分类29

四、与人类感染有关的支原体分类31

五、与人类感染有关的衣原体分类31

六、其他革兰阴性杆菌分类31

第二章 感染的变迁33

第一节 感染类型的变迁33

一、宿主的改变33

二、病原菌性质的改变34

三、感染疾病的改变34

四、感染特点的比较34

五、导致感染类型改变的因素35

二、与临床有关的厌氧细菌分类36

第二节 感染菌种类及抗性变迁36

一、感染菌种类的改变37

三、高耐和多重耐药菌株的不断增多38

二、耐药性急剧上升38

四、苛养细菌耐药性的出现39

第三节 病区间感染差异41

一、门诊和住院病人感染病原菌种类差异41

二、不同病区间菌株耐药性差异42

第四节 性传播疾病的病原变化44

一、性病的现代观念44

二、当代世界性病概况46

三、我国性病流行状况47

四、主要性病防治与细菌检验47

一、建立正确、快速的检验方法51

第三章 临床微生物室的任务和职责51

第一节 微生物室的临床检验任务51

二、与临床科室建立密切联系53

三、提高临床医生的细菌学基础理论水平55

第二节 临床细菌室在医院感染管理中的任务55

一、细菌学监测55

二、医院感染的监测56

三、定期和不定期的作细菌耐药趋势及病原学报告57

四、提高医院感染管理人员和各级医务人员的细菌学基础理论水平57

第三节 临床细菌室的教学任务58

一、初级进修人员的培养58

二、中级进修人员的培养58

四、研究生的培养59

三、高级进修人员的培养59

第四节 临床细菌室的自身建设60

一、临床细菌工作人员知识更新60

二、临床细菌室的质量控制61

三、不断更新检验方法，建立新的技术63

四、结合临床开展科学研究工作64

第2篇 微生物检验与临床67

第一章 血液及骨髓标本的微生物检验67

第一节 送检指征67

一、症状指征67

二、疾病指征68

第二节 标本采集、接种及注意事项70

一、标本采集70

三、重症监护病房患者的血流易感性70

四、骨髓培养70

二、标本接种72

三、注意事项74

第三节 血液和骨髓标本的检验方法76

一、检验方法76

二、各类主要微生物的检测步骤80

三、血液及骨髓检验程序84

第四节 结果报告及临床意义85

一、结果报告85

二、临床意义86

一、血中分离出的不常见细菌及意义92

第五节 血液细菌培养报告方式92

二、对临床各科送检血液或骨髓培养的几点要求的建议94

第二章 尿液标本的微生物检验96

第一节 送检指征96

一、症状指征96

二、疾病指征96

第二节 标本采集和注意事项97

一、标本采集97

二、注意事项98

第三节 常见微生物99

第四节 检验方法99

一、检验方法99

二、各类主要微生物检测步骤102

三、检验程序104

第五节 临床意义105

一、葡萄球菌106

二、肠球菌106

三、淋病奈瑟菌107

四、大肠埃希菌107

五、非发酵革兰阴性杆菌107

六、结核杆菌107

七、钩端螺旋体107

八、衣原体、支原体107

九、L型细菌108

二、疾病指征109

一、症状指征109

第一节 送检指征109

第三章 粪便标本的微生物检验109

第二节 标本采集和注意事项110

一、标本采集110

二、注意事项111

第三节 常见微生物111

第四节 检验方法112

一、检验方法112

二、各类主要微生物的检测步骤115

三、检验程序119

第五节 临床意义119

三、霍乱弧菌120

二、沙门菌属120

一、志贺菌属120

四、致腹泻的大肠埃希菌121

五、小肠结肠炎耶尔森菌122

六、空肠弯曲菌122

七、肉毒梭菌122

八、结核分枝杆菌122

九、金黄色葡萄球菌123

十、难辨梭菌123

十一、菌群失调症123

二、疾病指征125

一、症状指征125

第一节 送检指征125

第四章 痰及上呼吸道标本的微生物检验125

第二节 标本采集和注意事项126

一、标本采集126

二、注意事项127

第三节 常见微生物128

第四节 检验方法129

一、检验方法129

二、各类主要微生物检测步骤132

第五节 临床意义135

一、肺炎链球菌135

三、检验程序135

二、化脓性链球菌136

三、流感嗜血杆菌136

四、百日咳鲍特菌136

五、白喉棒状杆菌136

六、结核杆菌137

七、卡他布兰汉菌137

八、嗜肺军团菌137

九、沙眼衣原体137

十、奴卡菌138

十一、肺炎支原体138

一、症状指征139

二、疾病指征139

第五章 化脓和创伤标本的微生物检验139

第一节 送检指征139

第二节 标本采集和注意事项147

一、标本采集147

二、注意事项149

第三节 常见微生物149

第四节 检验方法和报告方式150

一、检验程序150

二、检验方法和报告方式151

第五节 临床意义153

第一节 送检指征157

一、脑脊液157

第六章 穿刺液的微生物检验157

二、胆汁159

三、胸水160

四、腹水161

五、心包液162

六、关节液162

七、鞘膜积液163

第二节 标本采集和注意事项163

一、脑脊液163

二、胆汁及穿刺液164

第三节 常见微生物164

第四节 穿刺液检验方法166

一、检验方法166

二、各类主要微生物的检测步骤169

三、检测流程173

第五节 临床意义175

一、革兰阴性球菌175

二、链球菌176

三、流感嗜血杆菌177

四、葡萄球菌178

五、革兰阴性杆菌178

六、产兰核李斯特菌179

七、结核杆菌179

八、奴卡菌179

九、真菌179

十、厌氧菌180

第七章 烧伤标本的微生物检验182

第一节 送检指征183

一、症状指征183

二、疾病指征183

第二节 标本采集和注意事项186

一、采集时间186

二、采集方法186

三、注意事项186

第三节 常见微生物187

第四节 检验方法187

一、涂片检查187

二、培养方法188

三、各类主要微生物检测步骤189

四、检验流程193

一、需氧菌194

第五节 临床意义194

二、厌氧菌198

三、真菌199

第八章 生殖道标本的微生物检验与临床201

第一节 送检指征201

一、症状指征201

二、疾病指征203

第二节 标本采集和注意事项208

一、标本采集208

二、注意事项209

第三节 常见微生物210

二、检验方法和报告方式211

第四节 检验流程和报告方式211

一、检验流程211

第五节 临床意义215

一、淋病奈瑟菌215

二、梅毒螺旋体219

三、杜克嗜血杆菌220

四、沙眼衣原体220

五、支原体222

六、结核分枝杆菌223

七、产单核李斯特菌223

八、性传播疾病(STD)与人免疫缺陷病毒(HIV)224

二、疾病指征226

一、症状指征226

第九章 组织标本的微生物检验与临床226

第一节 送检指征226

第二节 标本的采集和注意事项227

一、采集时间227

二、采集方法227

三、注意事项228

第三节 常见微生物229

第四节 检验方法与流程229

一、涂片检查229

二、培养方法230

三、各类主要微生物的检测步骤231

四、检验流程231

第五节 组织标本中分离出微生物的临床意义232

第十章 厌氧菌检验与临床234

第一节 厌氧菌感染指征234

一、症状指征234

二、易感因素235

三、疾病指征235

第二节 标本采集和运送249

一、标本采集249

二、标本运送250

第三节 厌氧菌检验流程251

第四节 临床常见感染的厌氧菌及临床意义254

一、按真菌菌落形态分类257

第十一章 真菌检验与临床257

第一节 真菌概论257

二、按感染部位分类258

三、按真菌致病性分类258

四、真菌的基本结构258

第二节 临床常见真菌感染及病原菌259

一、浅部真菌感染260

二、深部真菌感染261

三、条件致病性真菌感染261

第三节 真菌学检验的临床标本采集262

一、与真菌学检验有关的临床标本信息262

二、标本采集的一般要求262

三、临床常见标本的采集263

一、直接镜检265

第四节 真菌的实验室检验265

二、分离培养与鉴定266

第五节 新出现的深部感染条件致病真菌270

一、马尔尼菲青霉菌270

二、镰孢菌属270

三、多育足放线病菌属271

四、暗丝孢霉271

五、接合菌类271

六、糖秕马拉色菌271

第十二章 分枝杆菌检验与临床273

第一节 分枝杆菌分类273

一、结核分枝杆菌感染性疾病276

第二节 分枝杆菌感染性疾病276

二、非结核分枝杆菌感染性疾病280

第三节 分枝杆菌实验室检查283

一、微生物学检查283

二、药物敏感性试验288

三、动物试验288

四、其他诊断技术289

第四节 分枝杆菌耐药性292

一、常用化疗药物292

二、影响药物作用的因素298

三、分枝杆菌的耐药性299

四、化学治疗基本原则300

一、结核分枝杆菌耐药基因研究进展302

第五节 结核分枝杆菌耐药基因研究及检测302

二、耐药性检测304

第六节 结核分枝杆菌医院内感染及检测304

一、结核分枝杆菌的抵抗力304

二、医院内感染的流行病学305

三、医院内结核感染诊断标准306

四、医院内外结核感染的鉴别306

五、医院内结核感染的预防307

六、医院内结核感染监测308

二、PCR主要反应步骤311

一、PCR技术原理311

第一节 聚合酶链反应(PCR)技术311

第十三章 难分离微生物的检验技术311

三、扩增产物检测312

四、PCR技术在细菌检验中的应用范围313

五、PCR技术的实验室要求313

六、在PCR检测中几个需要解决的问题313

七、PCR在细菌学诊断方面的应用314

第二节 自动微生物免疫系统VIDAS的检测技术317

一、衣原体检测317

二、难辨梭菌毒素检测318

三、大肠杆菌O157检测319

四、VIDAS探针鉴定结核杆菌319

一、半自动分枝杆菌培养系统(Bactec-460)321

第三节 分枝杆菌快速培养系统321

二、MB/BacT全自动结核培养系统322

第十四章 细菌检验中自动化技术的应用326

第一节 自动化细菌鉴定系统326

一、Vitek-AMS自动细菌鉴定系统326

二、MicroScan自动细菌鉴定系统330

三、ATB Expression半自动细菌鉴定系统333

四、Sensitire荧光快速微生物鉴定/药敏分析系统335

第二节 自动血培养分析仪335

一、采用光电原理监测的血培养系统335

二、以检测培养基导电性和电压为基础的血培养系统337

三、应用感压原理的血培养系统338

第3篇 其他细菌检验与临床343

第一章 细菌的药物敏感试验343

第一节 概述343

一、细菌药物敏感试验在感染性疾病防治中的意义343

二、药敏试验分类与特点343

三、药物敏感试验的规则345

第二节 需氧及兼性厌氧细菌的药物敏感试验367

一、常见需氧及兼性厌氧细菌的药敏试验方法367

二、苛养细菌的药敏试验方法370

三、关于几种细菌的特殊药敏试验问题372

二、传统方法376

一、概述376

第三节 分枝杆菌药敏试验376

三、Etest方法377

四、Bactec-460380

第四节 厌氧菌的药物敏感试验382

一、概术382

二、琼脂稀释法382

三、Etest方法384

四、ATB系统385

第五节 酵母样真菌药敏试验385

一、ATB-FUNGUS真菌药敏试验385

第六节 联合抗菌药物药敏试验387

一、联合药敏试验的适应证387

二、Etest方法387

二、联合用药基本原则388

三、联合药敏试验的方法学388

第七节 体液中抗菌药物浓度测定及临床意义391

一、临床意义391

二、适应证391

三、采血时间392

四、测定方法392

第八节 抗菌药物耐药监测394

一、WHONET工程及耐药监测395

二、耐药监测的必要性395

三、耐药监测的意义396

四、合理使用抗菌药物和耐药监测397

第二章 医院感染管理与细菌检验401

第一节 医院感染监测范围401

一、流行病学监测401

二、传染源及环境监测413

三、ICU病房的监测及感染控制414

第二节 爆发流行预报415

一、调查步骤416

二、实验室工作417

三、注意事项418

第三节 肠球菌耐万古霉素基因的鉴别诊断418

一、检测方法419

第四节 耐甲氧西林的金黄色葡萄球菌(MRSA)菌株的监测420

二、VRE菌株基因鉴别测定420

三、核酸方法检测VER耐药基因420

一、纸片扩散法421

二、琼脂稀释法421

第五节 医院内消毒剂的应用监测421

一、概念421

二、医院常用消毒剂422

三、消毒液使用中的监测426

第三章 新药研究与细菌检验429

第一节 体外抗菌活性检测429

一、抗细菌药物的体外抗菌活性测定429

二、抗真菌药物的体外抗菌活性测定432

三、抗结核菌药物的体外抗菌活性测定434

第二节 体内抗菌活性检测435

一、抗细菌药物的体内抗菌活性测定435

二、抗真菌药物的体内抗菌活性测定437

三、抗结核菌药物的体内抗菌活性测定438

第三节 新药临床研究与细菌检验440

一、保证细菌学诊断阳性率441

二、准确、及时的药物敏感试验结果442

三、菌种保存与MIC测定442

四、清除率与转阴率446

附录一 临床常见细菌名称英汉对照447

附录二 微生物学常用词汇476

附录三 常见抗菌药物英汉对照489