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第一章 绪论1

第一节 细菌分类学的发展和趋势1

目录1

第二节 细菌的分类单元和命名规则2

一、细菌的分类单元2

二、细菌分类单元的命名规则4

二、普雷沃分类系统5

三、伯杰氏分类系统5

一、克拉西里尼科夫分类系统5

第三节 细菌的分类系统5

第四节 细菌在生物界中的分类地位及其系统发育研究8

一、细菌9

二、古细菌13

第二章 细菌的分类特征和细菌鉴定15

第一节 细菌的分类特征15

一、个体形态特征15

二、培养特征17

三、生理生化反应19

四、生态因子19

一、鉴定与分类的区别20

第二节 细菌鉴定20

五、细胞组分20

六、血清反应20

二、检索表21

三、鉴定的工作原则与步骤22

四、常规鉴定技术的发展23

第三节 细菌快速鉴定中的分子生物学技术24

一、核酸探针技术24

二、DNA聚合酶链反应（PCR）27

第四节 血清学快速鉴定方法29

一、免疫酶技术29

四、单克隆抗体技术30

第五节 分析微生物学检验技术30

三、免疫印迹杂交30

二、免疫荧光技术30

一、生长过程的测定31

二、细胞组分及代谢产物的分析31

三、细菌自动化鉴定系统31

第三章 细菌分类方法33

第一节 细菌的传统分类33

第二节 数值分类34

一、定义和原理35

二、工作步骤35

一、DNA碱基组成的测定40

三、小结40

第三节 细菌分类中的核酸分析40

二、DNA分子杂交技术43

三、16SrRNA同源性分析46

四、小结54

第四节 遗传学分类法54

第五节 化学分类法54

一、细胞壁组成55

二、脂肪酸组成及代谢产物分析57

三、蛋白质序列分析及电泳58

五、DNA限制性片段长度多态性（RFLP）分析59

四、多位点酶电泳（MLEE）59

六、其他方法61

第六节 血清学分类法63

一、细菌抗原类型63

二、常用分析技术63

三、免疫电泳64

第四章 革兰氏阴性细菌类群65

第一节 螺旋体目65

一、螺旋体科66

二、钩端螺旋体科67

二、螺菌属68

第二节 需氧（或微需氧）的、运动的、螺旋状（或弧状）的革兰氏阴性细菌68

一、水螺菌属68

三、固氮螺菌属69

四、海洋螺菌属69

五、蛭弧菌属69

第三节 不运动（或很少运动）的革兰氏阴性弯曲细菌70

第四节 革兰氏阴性、好氧（或微好氧）的杆菌和球菌71

一、假单胞菌科71

二、固氮菌科71

三、根瘤菌科72

四、甲基球菌科74

五、醋酸杆菌科75

六、奈瑟氏菌科76

七、未归入科的其他属78

第五节 兼性厌氧革兰氏阴性杆菌79

一、肠杆菌科79

二、弧菌科81

三、巴斯德杆菌科82

四、科地位不定的属83

第六节 厌氧、直的、弯曲的和螺旋状的革兰氏阴性杆菌83

第八节 厌氧的革兰氏阴性球菌84

第七节 还原硫酸盐或硫的异养细菌84

一、立克次氏体目85

第九节 立克次氏体和衣原体85

二、衣原体目86

第十节 枝原体86

一、枝原体属87

二、无胆枝原体属87

三、螺原体属88

四、植物和无脊椎动物的类枝原体88

第十一节 内共生体88

一、原生动物的内共生体88

三、真菌和其他无脊椎动物的内共生体89

二、昆虫内共生体89

第五章 革兰氏阳性细菌类群90

第一节 革兰氏阳性球菌90

一、微球菌科91

二、奇异球菌科92

三、未归入科的其他属92

第二节 产芽胞的革兰氏阳性杆菌和球菌93

一、芽胞杆菌属94

二、梭菌属94

第三节 不产生芽胞、形状规则的革兰氏阳性杆菌95

三、芽胞八叠球菌属95

二、利斯特氏菌属96

一、乳酸杆菌属96

第四节 不产生芽胞、形状不规则的革兰氏阳性杆菌97

一、棒杆菌属97

二、节杆菌属97

三、丙酸杆菌属98

四、放线菌属98

第五节 分枝杆菌类99

第六节 诺卡氏菌类99

五、双歧杆菌属99

第六章 古细菌、蓝细菌和其余的革兰氏阴性细菌类群101

第一节 不产氧的光合细菌101

一、紫色细菌102

二、绿色细菌106

第二节 产氧的光合细菌107

一、蓝细菌108

二、原绿菌目111

第三节 好氧的化能无机营养细菌111

一、硝化细菌112

四、氧化和（或）沉积铁与锰的细菌114

三、专性化能无机营养的氢细菌114

二、无色硫细菌114

五、趋磁细菌115

第四节 芽生和（或）有附属物的细菌115

一、有附属物、芽殖细菌类群116

二、有附属物、非芽殖细菌类群117

三、无附属物、芽殖细菌类群118

四、无附属物、非芽殖柄细菌类群118

第五节 鞘细菌119

第六节 非光合、无子实体的滑行细菌120

一、噬纤维菌目120

三、贝日阿托氏菌目122

二、溶杆菌目122

四、其他科和属123

第七节 产子实体的滑行细菌（粘细菌目）124

一、粘球菌科125

二、原囊菌科125

三、孢囊杆菌科126

四、多囊杆菌科126

第八节 古细菌126

一、产甲烷的古细菌群127

三、极端嗜盐的古细菌群130

二、还原硫酸盐的古细菌群130

五、极端嗜热的代谢元素硫的古细菌群132

四、无细胞壁的古细菌群132

第七章 放线菌135

第一节 多腔孢囊放线菌137

一、嗜皮菌属137

二、弗兰克氏菌属138

第二节 孢囊放线菌139

一、游动放线菌属139

二、指孢囊菌属139

一、链霉菌属140

三、游动单孢菌属140

第三节 链霉菌及相关菌属140

二、链轮丝菌属142

第四节 其他产生分生孢子的放线菌143

一、小单孢菌属143

二、高温放线菌属143

三、高温单孢菌属144

四、拟诺卡氏菌属144

五、马杜拉放线菌属144

参考文献145