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第一章绪论1

第一节 微生物生态学发展简史2

第二节 微生物生态学研究内容5

第三节 微生物生态学与其它学科的关系8

第四节 微生物生态学的任务10

第二章微生物生态学的基本原理12

第一节 环境的概念12

第二节 生物圈和生态系统14

第三节 能量流、食物链和营养级21

第四节 种群、群落和种间关系30

第五节 生物地球化学循环38

第三章环境中碳素的微生物转化41

第一节 碳素的生物地球化学循环41

第二节 土壤中碳素循环45

第三节 水域中的碳素循环47

第四节 碳素循环的平衡51

第五节 特殊类型碳素化合物的分解54

第六节 生物杀伤剂和碳素循环59

第七节 人类对碳素循环的影响62

第四章环境中氮素的微生物转化65

第一节生物圈内氮素的分布和生物地球化学循环65

一、水域中的氮67

二、土壤中的氮68

第二节氮素循环的微生物学68

一、硝化作用70

二、硝酸还原作用和反硝化作用72

三、固氮作用74

第三节 环境和农业活动对氮素循环的影响79

第五章环境中其它元素的微生物转化85

第一节 硫的转化85

第二节 磷素循环94

第三节 铁、锰和其它金属元素的转化97

第四节 硅的循环98

第六章土壤中微生物群落的结构和功能100

第一节 土壤化学、结构和环境100

第二节 土壤中微生物的生态分布104

第三节 土壤中常见的微生物类群111

第四节 土壤中微生物间的相互关系125

第五节 根际微生物133

第六节 土传病原微生物的生物学控制141

第七节 人类活动对土壤微生物的影响144

第七章水体中微生物群落的结构和功能149

第一节微生物生活环境中水的特性149

一、温度和水的密度149

二、溶解性气体和pH151

三、盐度153

四、阳光154

五、水流155

六、营养155

七、压力156

第二节水体中微生物群落的结构156

一、浮游生物158

二、漂浮生物169

三、石面微生物及其相关的群落170

四、沙面微生物及其相关的群落173

五、泥面微生物及其相关的群落175

六、植物表面微生物184

七、动物表面微生物187

第三节 水生环境的群落关系和食物网188

第四节 富营养化和污染189

第八章空气中微生物群落的结构和功能195

第一节 大气中微生物的生态分布196

第二节 气生植物表面的微生物201

第三节 室内空气中的微生物208

第四节 微生物与空气污染212

第九章微生物之间及其与植物和动物的相互关系214

第一节 微生物之间的相互关系215

第二节微生物与植物之间的相互关系222

一、植物表面附生微生物222

二、植物与微生物的共生体224

三、植物的寄生微生物234

第三节微生物与动物之间的相互关系236

一、动物与微生物的捕食关系236

二、藻类与动物的共生237

三、真菌与无脊椎动物的共生238

四、海洋生物和发光细菌239

五、蚯蚓肠道内的微生物239

六、低等白蚁消化道内的微生物240

七、培养真菌的蚂蚁242

八、食草哺乳动物消化系统中的微生物244

九、微生物与人体的关系248

十、微生物在动物体内的寄生251

十一、动物致病的某些生态学问题252

第十章环境污染和微生物254

第一节微生物形成的污染物255

一、微生物产生的毒性物质255

二、水体的富营养化257

三、重金属的甲基化259

四、酸性矿水的形成262

第二节环境污染物的微生物降解265

一、有机污染物的微生物降解265

二、无机污染物的微生物转化274

第三节污水的微生物处理276

一、天然水体的自净现象277

二、污水生物处理的作用机理278

三、污水生物处理的类型280

第四节选育高效菌株来处理特定废水287

一、氰（睛）化合物的分解菌287

二、分解酚的微生物288

三、高抗汞菌288

四、光合细菌289

第十一章微生物生态学的应用291

第一节生态工程的概念291

一、物质能量的多层分级利用292

二、物质的转化与再生292

三、无污染工艺292

四、多功能系统的完全代谢过程293

第二节微生物生态学在农业中的应用293

一、在菌根真菌研究中的应用294

二、植物土传病原菌的生态防治295

三、在土壤肥料方面的应用296

四、在畜牧业和饲养业上的应用297

第三节微生物生态学在工业中的应用298

一、在酿酒业中的应用298

二、沼气发酵的微生物生态学301

三、在有机酸发酵上的应用302

第四节微生物生态学在人和兽医中的应用303

一、营养调整304

二、抗菌调整304

三、活菌制剂304

第五节微生物生态学在环保中的应用305

一、活性污泥微生物生态学及其应用305

二、利用光合细菌处理高浓度有机废水306

第十二章微生物生态学的研究方法309

第一节研究样品的采集310

一、土壤样品310

二、污泥样品311

三、水样品313

四、空气样品314

第二节微生物的直接观察法314

一、埋片法315

二、毛细管法317

第三节微生物的计数法318

一、平板计数法318

二、液体计数法319

第四节微生物的生物量324

一、ATP测定法324

二、氯仿熏蒸法326

第五节微生物生化活性的测定328

一、氨化作用8

二、固氮作用330

三、纤维素分解作用333

四、酶活测定335

五、呼吸作用342

第六节BOD，COD的测定348

一、BOD的测定348

二、COD的测定350

第七节厌氧培养技术356

一、焦性没食子酸吸氧法356

二、充氮除氧培养法357

三、亨盖特氏转管法358

第八节微生物的鉴定359

一、鉴定微生物的常用方法360

二、各类微生物的检索表361

附录：389

一、拉汉对照名称389

二、英汉对照名词415

主要参考文献427