《表3 各组样品的菌群多样性》

《表3 各组样品的菌群多样性》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《水解单宁对凡纳滨对虾生长性能和肠道微生物的影响》


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对MiSeq测序原始数据处理后,4组样品共产生206192条优化序列,分别为54750(control)、42315(F1)、53141(F2)和55986(F3),对数据进行均一化处理后,4组样品总序列均值为40280。各样品中产生的OTU数目范围在284~351之间,一共有543个(表3)。OUT序列分析结果表明,这些分类单元主要属于24个细菌门,47个纲,97个目190个科和334个属,另外,还有一些OUT在分类上属于未鉴定(unclassified)序列。除了F2以外F1和F3的OUT数目均高于对照组。通常用Ace和Chao指数来度量样品菌群丰度(community richness),Shannon和Simpson指数来度量菌群多样性(community diversity)[22]。3个实验组的Shannon多样性指数均低于对照组,而Chao指数实验组均高于对照组,说明水解单宁的添加可能降低了菌群的多样性,但是使群落的丰度增加。等级丰度曲线结果显示,F3组的物种丰度最高,F2的物种丰度最低(图1)。对照组的物种均匀度最低,但丰度高于F2组,总体而言,除F2组外,实验组的物种丰度和均匀度均高于对照组。