《表3 各组样品的菌群多样性》
对MiSeq测序原始数据处理后,4组样品共产生206192条优化序列,分别为54750(control)、42315(F1)、53141(F2)和55986(F3),对数据进行均一化处理后,4组样品总序列均值为40280。各样品中产生的OTU数目范围在284~351之间,一共有543个(表3)。OUT序列分析结果表明,这些分类单元主要属于24个细菌门,47个纲,97个目190个科和334个属,另外,还有一些OUT在分类上属于未鉴定(unclassified)序列。除了F2以外F1和F3的OUT数目均高于对照组。通常用Ace和Chao指数来度量样品菌群丰度(community richness),Shannon和Simpson指数来度量菌群多样性(community diversity)[22]。3个实验组的Shannon多样性指数均低于对照组,而Chao指数实验组均高于对照组,说明水解单宁的添加可能降低了菌群的多样性,但是使群落的丰度增加。等级丰度曲线结果显示,F3组的物种丰度最高,F2的物种丰度最低(图1)。对照组的物种均匀度最低,但丰度高于F2组,总体而言,除F2组外,实验组的物种丰度和均匀度均高于对照组。
图表编号 | XD0099219200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.01 |
作者 | 郭慧、朱旭枫、陈锦霖、李广丽、朱春华 |
绘制单位 | 广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心、广东海洋大学水产学院湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室、广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心、广东海洋大学水产学院湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室、广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心、广东海洋大学水产学院湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室、广东海洋大学水产学院广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心、广东海洋大学水产学院湛江市海洋生态与养殖环境重点实验室、广东海洋大学水 |
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