《表7 CNVs区内基因注释》

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《皱皮香猪3个基因组拷贝数变异的多态性分布》


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使用VEP注释3个CNVs中的基因(表7),CNV1内有14个基因,分别是SFT2D1、PRR18、RPS6KA2、FGFR1OP、CCR6、UNC93A、MPC1、GPR31、RNASET2、TTLL2、TCP10L2和3个Novel基因(ENSSSCG00000034196、ENSSSCG00000036759、ENSSSCG00000040654);CNV2包含13个基因:KATNB1、ADGRG3、ADGRG1、DRC7、CCL17、RF00017、CX3CL1、COQ9、POLR2C、ADGRG5、CCDC102A、DOK4和CIAPIN1;CNV3有4个基因,其中LOC100513601的3′端不在该CNV3内,SLA-5、RF00001和ENSSSCG00000001231处于CNV3之中。