《表1 第一个聚类结构的TM-core》

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《距离和疏水模型辅助的蛋白质结构预测方法》


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实验中DHMA的预测结果与Rosetta和QUARK预测的结果进行比较,不仅因为Rosetta和QUARK是目前最成功的预测方法之一,主要是因为DHMA算法使用了QUARK预测的距离谱,同时DHMA算法的初始阶段和变异过程中都采用了Rosetta的能量函数.表1和表2中的DH、Ro和QU分别是DHMA、Rosetta和QUARK的简称,其中QUARK的预测结果直接通过QUARK在线服务器直接得到.DHMA算法与Rosetta的预测结果主要分3步得到: