《表4 拟南芥染色质重塑因子的功能分析》

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《染色质重塑因子在植物发育过程的功能》


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目前,植物染色质重塑复合体组成尚未完全分离鉴定,然而遗传和蛋白相互作用数据提示植物中也存在多种染色质重塑复合体(表1~3)。因此通过对染色质重塑复合体同源亚基的研究可从侧面探究植物染色质重塑复合体的功能。通过与酵母、果蝇和人的染色质重塑复合体ATPase亚基的同源比对,拟南芥含41个ATPase结构域(SNF2-like)基因,可分为Snf2-like、Swr1-like、Rad54-like、Rad5/16-like、SSO1653-like和SMARCAL1-like家族,每个家族又可细分为不同亚家族[32],如Snf2-like家族可分为SWI2/SNF2、Lsh、Iswi、Chd1和Mi-2亚家族,而Swr1-like家族则可分为Ino80、Swr1和Etl1亚家族。遗传和蛋白相互作用及IP-MS研究表明,拟南芥(Arabidopsis thaliana)SWI/SNF染色质重塑复合体亚基核心组分与酵母和动物相似,但含有更多同源基因(如与酵母SWI3同源的SWI3A/B/C/D),且有植物特有的亚基(图2)。这提示植物染色质重塑复合体可能具有与动物和酵母不同的功能。围绕各组成亚基的研究表明,这些基因参与细胞分化、器官发育和激素信号转导等多种生理过程(表4)。在拟南芥所有SNF2-N蛋白中Snf2-like(11个)和Swr1-like(4个)家族成员在序列上最有可能是植物染色质重塑复合体催化亚基,围绕这些基因所取得的研究成果也最丰富。在Snf2-like家族中,SWI2/SNF2亚家族(4个)、CHD1-Mi2亚家族(4个)、Iswi-Lsh亚家族(3个)和Swr1-like家族(4个)成员分别对应于SWI/SNF、CHD、ISWI和INO80/SWR1复合体催化亚基(表1~3)。