《表3 噬菌体vB_KpnP_IME279基因组一致性对比》

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《一株肺炎克雷伯菌噬菌体的生物学特性及全基因组分析》


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噬菌体vB_KpnP_IME279全基因组长度为42 518 bp,基因组为线性,其核酸序列NCBI登录号为MF614100。基因组A、C、G和T碱基含量分别为18.7%、29.7%、29.6%和22.0%,(G+C)mol%为59.3%。BLASTn分析结果如表3所示,共有4株噬菌体与噬菌体vB_KpnP_IME279基因组进行了对比,覆盖率为22%-70%,相似度在69%-80%之间,基因相似性较低。噬菌体vB_KpnP_IME279与其中2株相似度最高的噬菌体的基因组对比分析结果见图4。RAST基因注释结果显示共有59个开放阅读框(Open reading frame,ORF),其中有2个ORF起始密码为GTG,56个ORF起始密码为ATG,仅有1个ORF起始密码为GCG。CDS核酸序列长度在174-3 144 bp之间,对应的蛋白质序列长度在57-1 047 aa之间。全部的ORF共含39 765 bp的碱基,基因组基因密度高达93.5%。