《表3 噬菌体vB_KpnP_IME279基因组一致性对比》
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《一株肺炎克雷伯菌噬菌体的生物学特性及全基因组分析》
噬菌体vB_KpnP_IME279全基因组长度为42 518 bp,基因组为线性,其核酸序列NCBI登录号为MF614100。基因组A、C、G和T碱基含量分别为18.7%、29.7%、29.6%和22.0%,(G+C)mol%为59.3%。BLASTn分析结果如表3所示,共有4株噬菌体与噬菌体vB_KpnP_IME279基因组进行了对比,覆盖率为22%-70%,相似度在69%-80%之间,基因相似性较低。噬菌体vB_KpnP_IME279与其中2株相似度最高的噬菌体的基因组对比分析结果见图4。RAST基因注释结果显示共有59个开放阅读框(Open reading frame,ORF),其中有2个ORF起始密码为GTG,56个ORF起始密码为ATG,仅有1个ORF起始密码为GCG。CDS核酸序列长度在174-3 144 bp之间,对应的蛋白质序列长度在57-1 047 aa之间。全部的ORF共含39 765 bp的碱基,基因组基因密度高达93.5%。
图表编号 | XD008713100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.20 |
作者 | 王九儒、赵飞扬、李曼莉、裴广倩、范航、张湘莉兰、米志强、童贻刚 |
绘制单位 | 北京化工大学生命科学与技术学院、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、青岛农业大学动物医学院、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室 |
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