《表4 噬菌体IME279的ORF功能预测》

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《一株肺炎克雷伯菌噬菌体的生物学特性及全基因组分析》

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注：a：最相近基因组微生物物种的基因和名称；No hits：没有比对到相近的氨基酸序列；b:BLASTp搜索到比对百分比.

使用BLASTp对蛋白序列进行在线分析，共得到59个开放阅读框（Open reading frame，ORF），已知功能的ORF如表4所示。其中ORF1为AAA家族三磷酸腺苷酶，该类酶通常与各类细胞活动有着密切关系[16]。ORF16为Dcm甲基化酶，可将CCAGG和CCTGG序列中的胞嘧啶变为5-甲基胞嘧啶，该酶确切功能尚不清楚[17]。与噬菌体结构相关的蛋白为ORF12（头尾连接处蛋白）、ORF25（基底板相关蛋白）、ORF28（尾部纤维蛋白）、ORF37（噬菌体衣壳蛋白）、ORF38（支架蛋白）和ORF44（噬菌体门蛋白）。噬菌体门蛋白可以在衣壳中形成通道并有助于噬菌体基因组注入宿主细胞[18]。