《表1预测的完整前噬菌体区域在小肠结肠炎耶尔森菌基因组中的分布》
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《小肠结肠炎耶尔森菌基因组中前噬菌体基因结构特征分析》
注:噬菌体完整性评判标准:完整噬菌体(预测评分>90);可疑的噬菌体(预测评分为70-90);完整的噬菌体(预测评分<70)预测的前噬菌体数目中,括号外为全部噬菌体总数,括号内标记星号的为完整噬菌体个数。
71个预测的完整前噬菌体区域长度范围为6.7 kb~90.9 kb,平均长度为32.64 kb,cds编码区域为11~153个,GC含量范围40.03%~51.87%。表1显示,71个原噬菌体(Prophage1~71)具有完整噬菌体的编码功能,它们的噬菌体区域具有典型的噬菌体特征,如外壳蛋白、附着点、尾部因子、t RNA等编码序列。完整前噬菌体平均序列长度为40.29 kp,GC含量为65.64%,与小肠结肠炎耶尔森菌整个基因组中的GC含量类似。63个完整前噬菌体区域两端有噬菌体附着位点attL和attR,另外8个完整前噬菌体区域没有预测到噬菌体附着位点。
图表编号 | XD0080285700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.28 |
作者 | 梁俊容、景怀琦 |
绘制单位 | 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |