《表3 M2＿72H vs C组差异表达LncRNA靶基因GO term分类》

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《MT和FGF5调控辽宁绒山羊绒毛生长相关LncRNA的筛选及鉴定》

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分别根据Lnc RNA临近位置的（上下游10k/100k）蛋白编码基因和Lnc RNA与蛋白编码基因的表达量相关性分析或共表达分析方法来预测其cis/trans靶基因。再对靶基因分别进行cis和trans的GO富集分析，分别从生物过程（biological process，BP）、分子功能（molecular function，MF）和细胞组分（cellular component，CC）三个层面对靶基因进行GO注释。结果如表3、4所示:M2＿24H vs C、F4＿24H vs C和F6＿24H vs C组中差异表达的Lnc RNA均无显著富集的条目；M1＿24H vs C组中差异表达Lnc RNA的trans靶基因无显著富集的GO term，其cis靶基因只在BP中有一个显著富集的GO term，即negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter；M2＿72H vs C和F4＿72H vs C组中差异表达的LncRNA的cis靶基因均无显著富集的GO term，而M2＿72H vs C组trans靶基因主要富集在BP的cellular metabolic process biological＿process、nitrogen compound metabolic process biological＿process；MF中的binding molecular＿function、catalytic activity molecular＿function；CC中的membranebounded organelle cellular＿component、F4＿72H vs C组中差异表达的Lnc RNA的rans靶基因主要富集在BP的cellular metabolic process biological＿process、cellular macromolecule metabolic process biological＿process，CC的cell cellular＿component、cell part cellular＿component、intracellular cellular＿component，MF的binding molecular＿function中。