《表1 菌株ATW1-2的5.8S rDNA+ITS序列(544bp)》

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《北京地区元宝枫枯萎病病原菌的分子鉴定》


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以菌株ATW1-2基因组总DNA为模板,利用真菌通用引物ITS1和ITS4进行PCR扩增,PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳,长度为500bp左右(图3)。PCR产物连接至T载体,然后进行热激转化大肠杆菌,挑取阳性克隆进行序列测定,其长度为544bp,基因序列已提交至GeneBank,登录号为MN013922,具体碱基序列见表1。在www.ncbi.nlm.nlh.gov数据库中进行BLAST比对。由比对结果可知,ATW1-2的5.8S rDNA+ITS序列与Genebank已登录16个Fusarium oxysporum的rDNA-ITS序列都具有100%一致性,从而确定ATW1-2与F.oxysporum是同一个种。利用MEGA7.0.26软件中的Neighbor-joining Tree作进化树分析,结果表明ATW1-2与尖孢镰刀菌(F.oxysporum)(EU839398.1和EU839370.1)具有较近的亲缘关系(图4)。