《表1 东北人参主产区45株人参锈腐病菌的rDNA-ITS序列分析》

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《东北地区人参锈腐病菌的分子鉴定》


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采用ITS1/ITS4引物对45个菌株进行PCR扩增,均获得约500bp的核苷酸序列,将供试菌株的序列与Genbank中已知种的菌株序列进行BLAST比对,加入Campylocarpon fasciculare作为外源参考序列[15-19]构建系统发育树(图2)。结果表明,XB046等28株病原菌与毁灭柱孢(C.destructans)(AY677271) 相似性达到99%,聚在同一分支;R13等3株病原菌与毁灭柱孢毁灭变种(C.destructans var.destructans)(AM419065) 相似性达到99%,聚在同一分支;YL026等14株病原菌与强壮土赤壳(I.robusta)(AY295331,JF735264) 相似性达到99%,聚在同一分支(图1,表1)。因此将所有供试菌株鉴定为3个种:毁灭柱孢毁灭变种(C.destructans var.destructans),共有3个;毁灭柱孢(C.destructans),共有28个;强壮土赤壳(I.robusta),共有14个。