《表1 本文中使用的引物》

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《北极狐β-防御素103基因(CBD103)启动子活性及转录调控元件分析》


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课题组前期扩增获得北极狐CBD103基因序列2 327 bp(包括5′侧翼区2 071 bp、CDS区204 bp、3′侧翼区52 bp),并利用生物信息学的方法对启动子区及调控元件进行了预测[13]。根据预测结果,选取起始密码子上游2 000 bp左右的序列作为候选启动子区并设计引物(表1),PCR扩增4个缺失片段(图1)。。使用Primer Premier 5.0软件分析限制性内切酶位点。PCR扩增体系(50μL):其中基因组DNA 1μL,10×PCR缓冲液(Mg2+Plus)5μL,dNTP Mixture(2.5 mmol/L)8μL,上游引物(20μmol/L)1μL,下游引物(20μmol/L)1μL,LA Taq DNA聚合酶(5 U/μL)0.5μL,灭菌ddH2O 33.5μL。使用JASPAR、AliBaba 2.1、Nsite、Cluster和Signal SCAN在线网站预测启动子区的转录因子结合位点(表2)。