《表2 β-CD与黄芩苷分子对接结果的成簇分析及结合能》
(注:珚E表示平均结合能,n为构象簇数目,Ei为该簇构象的结合能,Xi为该簇构象在100次对接实验中所占的比例)
使用2.0的标准区分不同簇。以β-CD与黄芩苷的分子对接结果分析为例,分析分子构象及其结合能的大小,并以同样方法得出不同环糊精对黄芩提取物的结合能大小,比较不同环糊精对黄芩提取物的包合效果。从β-CD与黄芩苷分子的对接结果成簇分析图中可以看出,100次对接结果中,有19次对接构象形成的“最优势构象簇”,最低结合能为-5.47kCal/mol,占所有构象的19%。有7、8次构象分别形成第2、第3优势构象簇(图1)。对接结果成簇分析及结合能结果如下所示(表2),对接结果的平均结合能用以下公式(式1)算出:
图表编号 | XD007030000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.04.05 |
作者 | 雷奇林、苏青、凌保东、曹祥菊、潘映桥、杨逍、刘洁 |
绘制单位 | 成都医学院药学院、成都医学院药学院、四川省高校结构特异性小分子药物重点实验室、成都医学院药学院、四川省高校结构特异性小分子药物重点实验室、成都医学院药学院、成都医学院药学院、成都医学院药学院、成都医学院药学院 |
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