《表1‘豫杂一号’泡桐叶绿体基因组基因列》
注:a表示基因含有1个内含子;b表示基因含有2个内含子;c表示含有2个拷贝基因;d表示有4个拷贝基因
除了预测得到重复序列,我们还对简单重复序列进行了分析,共预测得到了67个SSR序列(图3),其中单核苷酸重复(Mononucleotide)数量是最多为50个,占总SSR序列的74.6%,数量最少的是五核苷酸(Pentanucleotide)重复,只检测到1个,而在泡桐属叶绿体基因组中没有检测到六核苷酸(Hexanucleotide)重复,这与葡萄中的研究是一致的。同时我们也发现,在这些SSR序列中,大部分的Mononucleotide为A/T;Dinucleotide为AT/TA;Trinucleotide为TTA和TTC;Tetranucleotide为AAAC、ATTG、GAAA、GTCT和TCTA;Pentanucleotide为TATTT。通过对这些结果分析发现,SSR序列大多是由聚胸腺嘧啶核苷酸(polyT)和聚腺嘌呤核苷酸(polyA)构成的,主要是A/T碱基,G/C碱基很少,这也就是‘豫杂一号’泡桐叶绿体基因组偏好A/T碱基的原因之一。
图表编号 | XD0065470400 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.06.01 |
作者 | 林丹、李冰冰、翟晓巧 |
绘制单位 | 河南农业大学泡桐研究所、河南农业大学泡桐研究所、河南省林业科学研究院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |