《表1 唐古特大黄叶绿体基因组基因分类》

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《基于高通量技术的唐古特大黄叶绿体全基因组测序及应用研究》


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统计表明,唐古特大黄叶绿体基因组共包含132(112种)个基因(图1),主要分为3大类,即88个(79种)蛋白编码(protein-coding gene,PCG)基因,36个(29种)转运RNA(transfer RNA,tRNA)基因,8个(4种)核糖体RNA(ribosomal RNA,rRNA)基因。其中,2个反向重复序列区分别有19个基因,为互相拷贝。在所有蛋白编码基因中,rps16、rpl20 2个(2种)基因因许多突变而失去正常功能,成为假基因(pseudogene),此外,与光合作用相关(photosystem I、photosystem II、cytochrome b/f complex、ATP synthase、NADH dehydrogenase、RubisCO large subunit)基因有45个(44种)、其他蛋白编码(RNA polymerase、ribosomal proteins-SSU、ribosomal proteins-LSU、Protease、maturase、Envelop membrane protein、c-type cytochrome synthesis gene、Translational initiation factor)基因35个(29种)、未知功能基因hypothetical chloroplast reading frames(ycf)6个(4种)(表1)。