《表2 Cloud_PERM算法并行化的加速比》

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《基于云计算的蛋白质折叠模拟计算》


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在Cloud_PERM算法采用不同物理节点个数(Slave=1,4,8,16,24,32)时分别对计算过程进行了模拟。所有的Slave节点都同时进行寻找能量最底的蛋白质结构,整个云平台中只要搜索到了能量为-71的空间构象,则蛋白质折叠模拟计算结束,记录下每次所消耗的时间,通过公式(2)计算出加速比(表2)。