《表3 植物MIR403转录起始位点预测》

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《miR403分子进化特性及其在龙眼体胚发生早期的表达模式分析》

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注:加粗碱基为转录起始位点。

根据上述得到的龙眼MIR403的TSS，往其上游提取2 800 bp为其启动子序列，并在NCBI中根据已登陆的拟南芥pri-miR403序列（登录号:EU549687.1），向前提取2 800 bp作为启动子。另外，通过柑橘、大豆和葡萄基因组数据库定位premiR403的基因座并采用BDGP和TSSP软件进行转录起始位点预测（表3）。结果显示，gma-miR403a、csi-miR403、vvi-miR403a/b/c/d/e均在BDGP中预测得到了可信的较高的TSS；除csi-miR403外，其余miR403成员的TTS均在其前体上游350 bp以内。而gma-miR403b和vvi-miR403f由于BDGP预测结果可信度较低，进一步通过TSSP预测其TSS，结果显示，其TSS在均其前体上游350 bp以内。分别从柑橘、大豆和葡萄基因组中提取得到各MIR403启动子序列2 800 bp。采用PlantCARE在线网站分析启动子顺式作用元件（图6）。