《表1 FRK基因的特征》
本研究利用生物信息学的分析手段,从拟南芥2个FRK基因入手,通过Blast对比程序,在已公布的甜瓜、黄瓜全基因组中共鉴定出3条甜瓜FRK基因、2条黄瓜FRK基因,分别命名为MELO-FRK1~MELO-FRK13、Csa-FRK1~Csa-FRK12。甜瓜属FRK基因在染色体上的分布无规律,在11号染色体上分布2个MELO-FRK基因,其余FRK基因分布于5号、6号、9号染色体上(表1)。从基因编码区长度、外显子数和内含子数的预测结果进行分析,可以推测出甜瓜属FRK基因家族具有一定的保守性,这些基因预测的编码区长度差异不大,MELO-FRK1、ME-LO-FRK2和Csa-FRK1的编码区长度都为996 bp、外显子数都为4、内含子数都为3;MELO-FRK3和Csa-FRK2的编码区长度都为1 047 bp、外显子数都为7、内含子数都为6。亚细胞定位预测结果显示,有3个FRK基因定位于胞外基质,2个FRK基因定位于细胞质中。
图表编号 | XD0059071400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.14 |
作者 | 徐雅菲、孙宇蛟、崔浩楠、王学征 |
绘制单位 | 东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院、东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学生命科学学院、东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院、东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室、东北农业大学园艺园林学院 |
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