《表2 数据产出质量统计表》

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《水分胁迫下马铃薯萌芽出苗期根系转录组差异表达分析》

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通过对DLWR(3个重复）、LWR(3个重复）和NWR(3个重复）样品的转录组测序，分别获得66 407 400，62 165 161和58 615 100条初始数据，经过整理和筛选分析，得到过滤后数据，分别为59 074 104，57 038 077和56 621 758，不同样本过滤后数据均有所下降，与初始数据相比，筛选后的数据分别占88.96%，91.75%和96.60%（见表2）．利用TopHat 2软件将过滤后的数据比对到基因组上，分布情况见图1．由图1可见，DLWR、LWR和NWR样本的数据83%以上都比对到外显子（exon）区域上，只有一小部分比对到内含子（intron）区域和基因间区（intergenic），比对到内含子区域的数据可能是由pre-mRNA的残留或可变剪切过程中发生的内含子滞留事件导致的，而比对到基因间区的数据可能是因为基因组注释不完全．各样本数据比对到基因组的频数有所下降，说明存在一定量的可变剪切或单倍型序列．