《表2 构建系统发育树时所引用的GenBank中小爪螨属物种的28S r DNA序列》

《表2 构建系统发育树时所引用的GenBank中小爪螨属物种的28S r DNA序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于28S rDNA分析板栗和杉木上针叶小爪螨物种分化原因》


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从NCBI网站上下载小爪螨属其他种(表2)及外群微小牛蜱(Rhipicephalus microplus)的28S r DNA序列(KC769636),运用MEGA5.2软件,基于Tamura-Nei模型,构建了NJ树、ML树和UPGMA树,3种系统树的拓扑结构相似,NJ树和ML树几乎完全一致,在此只展示NJ树(图2)。NJ树显示,杉木种群(KU886556)与采自日本的日本柳杉(Cryptomeria japonica)上的本岛小爪螨(O.hondoensis)(AB683722) 亲缘关系最近,板栗种群(KU886557)与采自日本的日本栗(Castanea crenata)上的栗小爪螨(O.castaneae)(AB683731) 的亲缘关系最近。杉木种群(KU886556)首先与本岛小爪螨(AB683722)聚在一起,再与采自日本的日本柳杉上的针叶小爪螨(AB683728)相聚,然后与板栗种群(KU886557)和栗小爪螨(AB683731)聚在一起。