《表5 Ⅰ类NDV F蛋白功能区氨基酸替代分析》

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《1株Ⅰ类新基因型新城疫病毒的基因组特性分析》

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注:a.不同Ⅰ类NDV F蛋白功能区氨基酸[13]

NX2209的F基因ORF全长为1 662bp，共编码553个氨基酸，F蛋白含有12个半胱氨酸（分别位于76aa、199aa、338aa、347aa、362 aa、370 aa、394 aa、399 aa、401 aa、424aa、514aa、523aa），有6个糖基化位点（分别位于86aa、192aa、367aa、448aa、472aa、542aa），5处中性抗原位点（分别位于72aa、74aa、78aa、157~171aa、343aa）（表4） ，裂解位点处的氨基酸为:112ERQERL117，具有NDV弱毒株的典型分子特征。将NX2209与NDV F蛋白功能区氨基酸参考序列进行比对分析，结果表明:NX2209在融合区发生2处变异，在七肽重复区（heptad repeat region，HR）和跨膜结构域各有5处变异（表5）。