《Table 1 Primers and sequence of EXT1 and EXT2 genes》

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《遗传性多发性外生骨疣家系的EXT基因突变检测》


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分别选取与EXT1、EXT2紧密连锁的STR位点:D8S1694、D8S522、D11S986、D11S1355,引物设计参照NCBI-UniSTS。根据EXT1基因序列(GenBank号NC000008),用在线Primer3软件(http://frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3-www.cgi)设计覆盖该基因11个编码外显子及其侧翼序列的引物共12对(其中EXT1基因第一外显子分两段扩增)。根据EXT2基因序列(GenBank号NC0000-11),用同样软件设计覆盖该基因2~14编码外显子及其侧翼序列的引物共13对。PCR扩增反应的总体积为25μl,dNTP终浓度为0.2μmol/L、引物终浓度为0.5μmol/L、Mg2+终浓度为2.5mmol/L,DNA聚合酶(Taq酶)1U(上海promega公司)模板量为100ng基因组DNA。PCR反应条件:94℃预变性5min;94℃变性40s,57℃复性40s,72℃延伸1min,33个循环;72℃充分延伸5min。PCR产物经6%的非变性聚丙烯凝胶电泳分型,电压500V,时间90min,常规银染。构建单体型进行连锁分析。引物序列见Table 1。