《表3 质粒的主要特征:IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的结构基因组学分析》
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《IncFII-FIA-FIB型多重耐药质粒pBTR-CTXM的结构基因组学分析》
注:pBTR-CTXM为本文测序质粒,pRSB107和pRSB225来自于GenBank.Note:pBTR-CTXM was fully sequenced in this work,while pRSB107 and pRSB225 were derived from GenBank.
pBTR-CTXM是全长144 939 bp的环状DNA分子,平均(G+C)mol%含量为51.85%,存在208个编码蛋白的开放阅读框(表3)。p BTR-CTXM含有3个复制子Rep FII、Rep FIA和Rep FIB,属于Inc FII-FIA-FIB型质粒。纳入分析的质粒共3个:第一个完整测序的Inc FII-FIA-FIB型质粒p RSB107[9](Gen Bank登录号为AJ851089);p BTR-CTXM(本文);与p BTR-CTXM覆盖度、核酸一致性最高(86%+99%)的质粒pRSB225(GenBank登录号JX127248)[29]。根据基因编码蛋白质的功能差异,这些质粒均可分为骨架区和外源插入区(图2)。每个质粒的外源插入区均包括一个MDR区、ugp操纵子、iucABCD-iutA基因簇和一些分散的插入序列等(表3)。
图表编号 | XD0043791800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.20 |
作者 | 李曼莉、王利君、赵亚超、蒋昭芳、周冬生、童贻刚、赵宝华 |
绘制单位 | 河北师范大学生命科学学院、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、清华大学附属北京清华长庚医院清华大学临床医学院、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室、河北师范大学生命科学学院 |
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