《表1 引物信息:从新生儿标本中分离3株ST1642型产NDM-5型碳青霉烯酶大肠埃希菌》

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《从新生儿标本中分离3株ST1642型产NDM-5型碳青霉烯酶大肠埃希菌》


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煮沸裂解法提取3株CR-ECO菌株的DNA模板。PCR技术扩增碳青霉烯酶基因(blaKPC、blaIMP、blaVIM和blaNDM)及超广谱β-内酰胺酶基因(blaCTX-M、blaSHV、blaTEM)、头孢菌素酶基因(blaFOX、blaDHA、blaCIT)、喹诺酮类耐药相关基因(qnrA、qnrB、qnrC、qnrD、qnrS)。用Primer 6.0引物设计软件,并参考pNDM 10505(NC_019069.1)和pNDM_MGR194(NC_022740.1)设计blaNDM基因引物序列,参考pEK499(NC_013122.1)和p HK08(NC_019072.1)设计blaCTX-M基因引物序列,其余引物来自文献[5-13],引物信息见表1。PCR反应体系为25μL:PCR mixture 12.5μL,ddH2O 8.5μL,上、下游引物(10μmol/L)各1.0μL,DNA模板2.0μL。PCR反应条件:94℃3 min;94℃30 s,退火(温度见表1)30 s,72℃1 min,30个循环;72℃8 min。PCR扩增产物经10 g/L琼脂糖凝胶电泳观察结果,阳性扩增产物送上海生工生物公司测序,测序结果在NCBI经BLAST比对分析。