《表3 SCoT-PCR反应体系正交试验结果均值》

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《不同产地广藿香的SCoT分子鉴定》

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使用引物S12对反应体系优化的电泳结果见图1，参考桂腾琴等[12]直观评价法依次对结果多态性进行评分，条带数量丰富、清晰的计16分，涂布或无条带的计1分，反应1～16组体系的平均整数计分依次为8、9、15、16、8、9、11、12、10、10、7、9、13、12、14、11分。依照计分原则，计算同一水平下各个因素的平均值Kn（表3）。根据各因素水平下的得分数据平均值Kn（K值得分最高）可以确定各个因素的最适浓度。由表3中的K值可以初步确定5个因素的最适用量分别为1×PCR buffer，3.0 mmol/L Mg2+，0.30mol/L dNTPs，0.6μmol/L Primer，1.25 U ExTaq酶，40 ng模板DNA。但鉴于1.00 U Ex Taq酶与1.25 U Ex Taq酶组评分不相上下，从经济角度考虑体系最终确定为1×PCR buffer，3.0 mmol/L Mg2+，0.3 mol/L