《表1 所有转录本信息及lncRNAs过滤分析结果》

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《3个时期牛肌肉组织中长链非编码RNA表达谱的生物信息学分析》

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SampleFilter，样本lncRNA过滤后总数量；CPCFilter（score≤-1），CPC软件过滤后评分≤-1的lncRNA总数量；CNCIFilter（ （length≥200）&（exon≥1）&（score≤0）） ，CNC软件过滤后长度≥200&外显子数≥1&评分≤0的lncRNA总数量SampleFilter，Total number of sample lncRNA aft

对测序获得的所有已知和未知转录本进行筛选过滤分析，结果见表1。由表1可知，共鉴定到330 649条不同的潜在lncRNAs转录本，3个不同时期样品中共计480 108条（包括不同样品中存在的相同lncRNA），经编码能力预测筛选后最终确定212 851条未注释的候选lncRNAs。3个时期lncRNAs分类分析结果见表2。由表2可知，对3个时期中获得的lncRNAs进行对比分类后发现，未被注释的候选lncRNAs主要属于基因间型、正义链型、反义链型和双向型4种类型，其中大多数属于基因间型，未发现有内含子型的lncRNAs。