《表1 人SETD2基因转录本的基本生物学信息》

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《SETD2调控组蛋白甲基转移酶H3K36me3的分子机制及其与肿瘤的关系》


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本表内容根据Ensembl数据库整理

SETD2别名亨廷顿蛋白相互作用蛋白1,最早由人造血干细胞分离。人类SETD2基因位于3号染色体短臂(3p21.31),长约192 kb,由23个外显子和22个内含子组成,有9个转录本(剪切变体),各转录本基本生物学信息见表1。全长SETD2蛋白质由2 564个氨基酸组成,分子量为280 KDa。SETD2蛋白包含多个结构域,包括(1)SET(Suvar3-9,Enhancer-of-zeste,Trithorax)域:由AWS、SET和PS(post-SET)模体组成,该结构域是执行组蛋白H3第36位赖氨酸单甲基化(H3K36me)转移的催化结构域[1]。(2)H4/H2A相互作用域:由一小段酸性残基组成,其作用可能是稳定核小体上的SETD2或将酶结构域定位在组蛋白H3第36位赖氨酸(H3K36)残基上[1]。(3)WW和CC域:两者均为保守区域。WW结构域是富含脯氨酸的蛋白质结合。在细胞核中,RNA聚合酶Ⅱ(RNAPⅡ)的C末端结构域(CTD)会通过与具有该结构域的蛋白质结合调节转录。在某些蛋白质中,CC结构域能够促进同源二聚化。(4)自抑制结构域(AID):位于SET和WW域之间,作用是抑制SETD2过度活跃,减少核小体和ATM基因上H3K36me的数量并影响SETD2与RNAPII的作用。(5)Set2-Rpb1相互作用(SRI)域:通过RNAPII的丝氨酸2(Ser2)和丝氨酸5(Ser5)双磷酸化CTD重复序列,与H3K36甲基化一起参与转录的延长[2]。