《表1 不同病情指数样品OTU统计表》

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《茶白星病不同病情等级下叶际细菌群落多样性与功能预测》


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原始数据经过处理后共获得111335条高质量序列片段,平均为37112条,见表1;在97%的相似水平下的OTU进行生物信息统计分析,见图1。其中检测到1925个OTUs,随着病情等级提高,OTU的相对丰度与病情等级呈正相关。BCK、B2和B4中特异OTU分别占33.75%、53.32%和59.29%,所有的样品中共检测到166个重合OTUs,占所有样品OTU总数的8.62%;BCK、B2和B4中独有OTU分别占14.95%、20.20%和27.21%(图2)。在所有样品中共鉴定到细菌36个门、56个纲、81个目和175个科、438个属。在门的水平上,占优势的门到属依次为Proteobacteria(变形菌门)、Alphaproteobacteria(变形菌纲)、Sphingomonadales(鞘脂单胞菌目)、Sphingomonadaceae(鞘脂单胞菌科)和Sphingomonas(鞘脂单胞菌属),分别占OTUs的83.09%、53.96%、31.13%、31.62%和30.62%(图1)。通过计算不同分类水平上鉴定出来的种系型,不同发病程度的细菌种类主要分布在Proteobacteria(变形菌门),优势纲则为Alphaproteobacteria与Betaproteobacteria(B-变形菌)。在属的水平上,它们在不同的病情等级上具有不同的相对丰度,表生细菌优势菌为Sphingomonas(鞘脂单胞菌属)与Ralstonia(雷氏菌属)。