《表2 不同引物对扩增下样品内生真菌OTU数据统计》
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《不同扩增引物对高通量测序分析盐角草内生真菌多样性的影响》
注:表格对角线下半部分数据为两两处理共有OTU数,上半部分百分数据是两两共有OTU数占全部的百分比.
根据各引物对所得序列OTU注释结果分析,去除非真菌OTU后,合并分类相同的OTU,构建韦恩图(图2)。不同引物所得序列共获得真菌OTU数为102个,其中以ITS1-1F引物对扩增获得55个OTU,以ITS1-5F引物对扩增获得44个OTU,以ITS2引物对扩增获得25个OTU。3种引物扩增均检测到的OTU为5个,占总共获得OTU的4.9%。ITS1-1F和ITS1-5F两种引物对扩增重叠检测出的OTU为13个,占总数的12.7%,这一结果表明采用不同引物进行扩增所得的盐角草(S.europaea)内生真菌信息存在明显的差异;而两者合计所得OTU为86个,占全部OTU数的84.3%,表明采用ITS1-1F和ITS1-5F两种引物对可基本反应盐角草(S.europaea)内生真菌的主要群落组成(表2)。
图表编号 | XD00124791900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 张志东、朱静、唐琦勇、顾美英、楚敏 |
绘制单位 | 新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室 |
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