《表3 不同引物扩增下内生真菌α多样性》
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《不同扩增引物对高通量测序分析盐角草内生真菌多样性的影响》
采用α多样性指标中物种数、Simpson(J)、Shannon(H)、Brillouin指数对样品群落的异质性以及估计群落中物种总数,一般而言Simpson(J)指数对富集种更加敏感,Shannon(H)对稀疏种更为敏感。由表3可以看出,ITS1-1F引物对扩增下OTU数明显高于ITS2、ITS1-5F,而Simpson(J)、Shannon(H)、Brillouin指数均低于后两者,表明采用ITS1-1F引物对能更多地获得内生真菌群落组成信息,但检出的物种间相对丰度差异较大,物种间均匀度降低。其中,Simpson(J)降低表明采用ITS1-1F引物对能明显增加优势菌群的检出率,而Shannon(H)降低表明该引物能更多覆盖低丰度的真菌种群。
图表编号 | XD00124791200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 张志东、朱静、唐琦勇、顾美英、楚敏 |
绘制单位 | 新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室、新疆农业科学院微生物应用研究所新疆特殊环境微生物实验室 |
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