《表3 11个差异表达基因的q RT-PCR验证》

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《在小檗碱作用下水稻细菌性条斑病菌生理及转录反应分析》

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将小檗碱处理组和对照的基因组进行比对，差异表达基因有780个（Padj≤0.05且|log2Fold Change|≥2），其中上调基因519个，下调基因261个。选取11个差异表达基因进行q RT-PCR验证，6个上调基因：flt E（XOC＿RS10310）、che W(XOC＿RS09985）、rpm B(XOC＿RS01655）、fab G(XOC＿RS05150）、hfq(XOC＿RS12320）、ndk(XOC＿RS10645）；5个下调基因gnd(XOC＿RS03170）、mdh(XOC＿RS04665）、hrp B2(XOC＿RS19780）、hrp B1(XOC＿RS19785）、cys K(XOC＿RS15915）。q RT-PCR结果表明，6个上调基因的2-ΔΔCt值>1，5个下调基因的2-ΔΔCt值<1（表3），表达变化模式与转录组测定表达趋势一致，说明转录组测序结果的可信度较高。