《表2 不同方式提取水稻种子总RNA的检测结果》

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《水稻种子总RNA提取质量问题的探究》


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如图1所示,与水稻幼嫩叶片相比,由于水稻种子富含淀粉等多糖和多酚类物质干扰,裂解液呈粘稠状,无法抑制RNA酶活性,无法提取到有效的总RNA用于后续实验(图1B)。用Gene Mark试剂盒法提取的种子总RNA虽然能看到相对完整的28S和18S条带,然而条带暗淡,浓度偏低,5S条带反而较为明亮(图3A);OD260/OD280和OD260/OD230均大于2.0(表2),说明提取的总RNA中蛋白质和盐类物质清除干净,而28S和18S条带降解严重,该试剂盒对RNA酶的抑制效果不佳。而经艾德莱试剂盒法提取的种子总RNA中5S条带暗淡,28S和18S条带较明亮、清晰(图3B);此外,该总RNA的OD260/OD280值在2.0~2.2之间(表2),说明杂质含量较少。经生物分析仪(Agilent 2100Bioanalyzer)进行浓度和RIN完整性检测,总RNA样品中28S峰、18S峰和5S峰均清晰可见(如图4B),与琼脂糖电泳结果基本一致,说明艾德莱试剂盒法提取的种子总RNA具有很好的完整性。因此,3种不同的提取方式中,采用艾德莱试剂盒提取水稻种子的总RNA比另外2种方式效果更好。