《表2 利用MISA软件确定SSRs的分布Table 2 Distribution of identified SSRs using the MISA software》

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《两种黄连转录组中SSR位点信息分析与多态性引物开发》

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黄连转录组中共获得总长度39 753 175 bp的55 903条Unigenes，其中，4 071个SSR位点被找到，452个Unigenes包含1个以上的SSR位点。在转录组数据中，没有发现单核苷酸重复基元位点。另外，其他重复基元位点数分别为二核苷酸1 447（35.54%）、三核苷酸2 124（52.17%）、四核苷酸294（7.22%）、五核苷酸73（1.79%）以及六核苷酸133（3.27%），由此可见，黄连中SSR位点主要为二核苷酸和三核苷酸重复，共占总SSR的87.71%（表1）；从重复次数上来看，5次重复出现频率最高，共1 266个，占总SSR的31.10%，其次为6次重复，共1 254个，占总SSR 30.80%，>12次的重复个数基本为0，12次重复个数最少为5个（表2）。