《表1 番茄Sl HSP20基因簇成员的鉴定》
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《番茄串联重复SlHSP20基因簇特征及差异表达分析》
利用t BLASTn在番茄基因组中鉴定4个Sl HSP20基因,分析番茄基因簇中4个串联基因的氨基酸长度、分子质量、不稳定指数及等电点等,根据氨基酸的分子量大小分别对基因簇成员命名为:Sl HSP17.6A、Sl H-SP17.6B、Sl HSP17.6C和Sl HSP17.7A。基因簇成员均具有典型的β折叠结构的保守ACD结构域。根据基因组序列分析显示番茄Sl HSP20蛋白大小一致,番茄Sl HSP20基因簇(Sl HSP17.6A、Sl HSP17.6B、Sl HSP17.6C和Sl H-SP17.7A)蛋白编码154个氨基酸,分子质量变化范围为17.6~17.7k Da,其中Sl HSP17.7A分子量最大,为17.7k Da,番茄s HSPs基因簇成员等电点变化为5.57~5.84之间,等电点最低的是Sl HSP17.6C,等电点为5.57,等电点最高的是Sl HSP17.6B、Sl HSP17.7A,等电点为5.84,说明番茄基因簇Sl HSP20蛋白为酸性(表1)。
图表编号 | XD00226038300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.01 |
作者 | 马健、李娇、姜晶 |
绘制单位 | 沈阳农业大学园艺学院、设施园艺省部共建教育部重点实验室、辽宁省设施园艺重点实验室、沈阳农业大学园艺学院、设施园艺省部共建教育部重点实验室、辽宁省设施园艺重点实验室、沈阳农业大学园艺学院、设施园艺省部共建教育部重点实验室、辽宁省设施园艺重点实验室 |
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