《表2 单细胞全基因组扩增方法比较》
注:#即copy number variation,拷贝数变异;&即single nucleotide variants,单核苷酸位点变异
全基因组/转录组扩增的目标是在没有序列偏差的前提下大幅增加核酸总量,一般由纳克水平扩增到微克水平。目前WGA方法主要有:基于热循环以P C R反应为基础,如引物延伸预扩增PCR(primer extension preamplification PCR,PEP-PCR)、简并寡核苷酸引物PCR(degenerate oligonucleotide primed-PCR,DOP-PCR)、标签随机引物PCR(tagged random primer PCR,T-PCR);基于等温反应不以PCR为基础,如多重置换扩增法(multiple displacement amplification,MDA);基于多次退火环状循环(multiple annealing and looping based amplification cycles,MLBAC)的扩增技术;还有新近研发的乳化液全基因组扩增(emulsion whole-genome amplification,eWGA)、转座子插入线性扩增法(linear amplification via transposon insertion,LI-ANTI)[18]、微流控反应器单链测序法(single-stranded sequencing using microfluidic reactors,SISSOR)[19]以及Pico PLEX[20]。以上WGA方法的优缺点详见表2。
图表编号 | XD00225420900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.01 |
作者 | 李贱成、徐克前 |
绘制单位 | 中南大学湘雅三医院医学检验系、中南大学湘雅医学院医学检验系、中南大学湘雅三医院医学检验系、中南大学湘雅医学院医学检验系 |
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