《表3 异位发酵床中菌群Alpha多样性指数》

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《垫料对异位发酵床中四环素抗性基因及Ⅰ类整合子丰度的影响》

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采用Illumina高通量测序对微生物菌群进行多样性分析，表3为8个采样单元的Alpha多样性指标。Chao1指数常用作量度群落的物种总数，Chao1指数越大代表物种数越多[31]，锯末+谷壳发酵床垫料的OTUs和Chao1指数均高于酒糟发酵床垫料，即锯末+谷壳发酵床垫料的物种数更多，说明大多数微生物菌群更适宜在锯末+谷壳发酵床的环境条件下生长繁殖。Shannon指数能够反映基于物种数的微生物群落多样性，该指数越大说明微生物群落的复杂程度越高[32]。由表3可以看出锯末+谷壳发酵床垫料的Shannon指数总体高于酒糟发酵床垫料，但S4的数值略低，可能是S4中重金属含量太高从而抑制了一些微生物的正常生长活动。Simpson指数越大，优势菌群生物量占总生物量比重越小[33]，从表3中可以得知两类发酵床垫料的数值无明显差别。因此，锯末+谷壳发酵床具有更丰富的微生物群落，但两者优势菌群的比重无明显差别。