《表2 不同疾病高丰富的细菌种类[45]》

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《宏基因组学在哺乳动物肠道微生物中的应用》

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肠道菌群能合成许多机体必需的营养素（如维生素和短链脂肪酸等），并具有参与糖类和蛋白质的代谢，以及代谢药物和环境中毒素等重要功能。肠道菌群参与机体肠道的正常发育和生理功能，在神经系统、代谢系统和免疫系统中均发挥着重要作用。大量报道显示，肠道菌群与各种消化系统疾病如炎症性肠病（inflammatory bowel disease，IBD）[29]、肠易激综合征（irritable bowel syndrome，IBS）[30]、与肥胖有关的代谢疾病（如动脉粥样硬化[31]和2型糖尿病 （type 2diabetes，T2D）） [32]、神经系统疾病（如阿尔茨海默病）[33-34]、遗传性过敏症和哮喘[35]、癌症[36]等多种疾病都具有一定的相关性（表2）。Peterson等[37]基于16SrRNA测序后发现，在克罗恩病人结肠中的拟杆菌和厚壁菌门数目减少，肠杆菌科如中黏附侵袭性大肠杆菌（adherent-invasive E.coli）和其他变形杆菌（Proteobacteria）的数量增加。Larsen等[38]研究发现，2型糖尿病与健康人群肠道菌群在门类和属类之间有显著变化，糖尿病患者的厚壁菌门相对丰度降低，但拟杆菌门和变形菌门的数量相对升高。Ridlon等[39]报道，在肝硬化患者肠道内梭菌属、肠杆菌科、紫单胞菌科比健康人明显增多。Nylund等[40]采集了15名患有湿疹病的婴儿和19名健康婴儿粪便样品，对患有湿疹的儿童肠道微生物进行研究发现，健康婴儿肠道中富含拟杆菌，患病婴儿的肠道中梭菌属的数量会显著增加。