《表2 玉米杂交种纯度鉴定候选引物表》

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《玉米杂交种纯度鉴定SNP核心引物的确定及高通量检测方案的建立》


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根据335份国家审定玉米杂交种标准样品的SNP指纹数据[17]统计384基础位点的双亲互补率、最小等位基因频率(minimum allele frequency,MAF)、多态性信息含量(polymorphic information content,PIC)等参数,挑选出在染色体上分布均匀,多态性好的60个位点作为纯度候选位点,并设计合成KASP引物(表2)(LGC Genomic,英国),在2条正向引物序列的5′端加上FAM或HEX荧光基团的接头序列[18],并按照上游引物12μmol L–1,下游引物30μmol L–1混合制备成引物工作液备用。