《表1 小麦籽粒钙含量QTL的汇总》

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《小麦籽粒钙元素含量的研究进展》


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a在2个环境和BLUE值(阈值为-log10 (P-value≥3))中均与籽粒钙含量显著关联的标记。

数量性状基因座(QTL)分析是解析小麦矿物质含量性状的有效方法,广泛应用于作物数量性状遗传研究。利用QTL分析能有效检测与小麦籽粒钙含量的相关基因位点,从而提高富钙小麦育种的效率。目前,关于小麦籽粒钙含量的基因定位研究较少。Peleg等[73]通过连锁分析定位到9个控制籽粒钙含量的QTL,位于1A、4A、6A、2B、4B、5B、6B和7B染色体(表1),解释表型变异1.0%~21.0%;除了4B染色体,位于其他染色体上的QTL均在所有环境中检测到;6B染色体上的QTL位点同时与钙、锌和铁含量相关;7B染色体上的QTL位点同时与钙、籽粒蛋白质含量、钾和锰含量相关,说明这些QTL同时可用于改良籽粒钙、锌、铁、钾和锰含量。Shi等[74]在1A、2A、7B和2D染色体上定位到4个控制籽粒钙含量QTL (表1),解释表型变异5.8%~14.0%;在1A染色体上检测到的QTL,其遗传距离位于10.1~10.9 c M之间,这与Peleg等[73]报道的QTL (5.0~58.7 c M)的异同还有待于进一步验证;在7B染色体上检测到的QTL (0~9.7 c M)与Peleg等[73]报道的遗传距离位于15.2~30.8 c M之间的QTL不同。Alomari等[30]以353份欧洲小麦品种为材料,对籽粒钙含量进行全基因组关联分析,共发现485个与籽粒钙含量显著关联的单核苷酸多态性(SNP)标记,分布在除3D、4B和4D以外的所有染色体上,其中在2个环境和BLUE值(阈值为-log10 (P-value≥3))中均与籽粒钙含量显著关联的标记位于2A、3A、5A、6A、5B和5D染色体上(表1);在这6条染色体上与籽粒钙含量显著相关的SNP位点附近找到了41个与钙吸收或转运相关的候选基因。植物钙转运蛋白已被证实了可增加胡萝卜等可食根的钙含量[75]。在2A和6A染色体上检测的位点与Shi等[74]和Peleg等[73]报道的不同。Bhatta等[21]通过对123份人工合成六倍体小麦种质的籽粒钙含量进行全基因关联分析,在3A、6A、7A、1B、2B、3B、6B、2D和3D染色体上发现了15个与籽粒钙含量显著关联的SNP标记(表1),解释表型变异2.7%~21.5%。由于所用群体(RILs、DHs或自然群体)、标记不同(AFLP、SSR、DAr Ts、90K)或准确位置信息缺乏或IWGSC Ref Seq v1.0以外的其他版本参考小麦基因组使用,在3A染色体上定位的QTL与Alomari等[30]、6A染色体上定位的QTL与Peleg等[73]和Alomari等[30]以及在2B、6B染色体上定位的QTL与Peleg等[73]的异同还有待于进一步验证。Shen等[63]在RILs群体中发现了位于4B染色体上调控钾、钙和镁含量的QTL位点,但没有定位到控制籽粒钙含量的QTL。以上研究仅限于初步QTL定位水平,尚未有精细定位的研究结果,也不清楚调控小麦籽粒钙含量的基因是什么。钙依赖性蛋白激酶(CDPKs)作为植物细胞中钙浓度变化的关键传感器,在小麦中鉴定出20个CDPK基因[76]。近年来,在拟南芥、穇子(finger millet)和水稻上有关籽粒钙含量的研究较多,不仅开发了用于检测籽粒钙含量的EST-SSR标记和SSR标记[77-78];同时也发现了一些调控籽粒钙含量基因,如CAX[61,79-80]和TPC、Ca MK、Ec CIPK基因家族[59]。相对于籽粒钙含量,小麦籽粒中铁、锌、硒元素基因定位的研究进展较快,不仅QTL定位研究较多[11],而且还成功克隆到一个提高籽粒蛋白质、铁和锌含量而对产量无影响的基因GPC-B1[81]。