《表4 PMA-q PCR和平板计数法检测5种乳杆菌活菌数》
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《叠氮溴化丙锭-荧光定量PCR法实时快速检测5种乳杆菌活菌数方法的建立与应用》
按照1.2.6的方法评估PMA-q PCR法检测乳杆菌含量的可靠性,结果如图3A所示,Cq值的变异系数均小于1%,表明在实验浓度范围内,该方法具有良好的重复性。t检验证明在103-108 CFU/mL范围内,PMA-q PCR与平板计数法测得的不同乳杆菌的含量在统计学上没有显著性差异(P>0.05)(Lactobacillus fermentum为103 CFU/mL时和Lactobacillus除外)(图3B)。当样品中发酵乳杆菌的含量接近检测限103.2 CFU/mL时,PMA-q PCR的检测准确性出现降低(P<0.05),尽管如此,其检测结果仍与平板计数检测结果处于同一数量级(表4)。而较差的乳杆菌属定量检测结果反映了以16S rRNA基因为靶基因区域定量检测的局限性,这与16SrR NA基因在不同乳杆菌基因组DNA中的拷贝数不同有关。通过拷贝数矫正微生物组的丰度对于样品中微生物检测具有重要意义,文献[24]表明通过rrnD B数据库(https://rrndb.umms.med.umich.edu/)可以查找细菌和古菌的16S rRNA基因拷贝数,进而矫正相应拷贝数。
图表编号 | XD00210323800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.20 |
作者 | 段亮杰、沙雨婷、罗意、夏小乐 |
绘制单位 | 江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院、江南大学生物工程学院、江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院、江南大学工业生物技术教育部重点实验室、江南大学生物工程学院 |
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