《表2 基因组结构信息统计》

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《一株新的产吡咯喹啉醌甲基营养菌全基因组测序和比较基因组学分析》


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如表2所示,Methylobacterium sp.NI91相对于M.extorquens AM1的4个质粒全部丢失、基因组“缩水”约100 kb。对两菌株的染色体进行共线性分析如图6所示,虽然两者互相存在一定程度的基因大片段缺失,但是总体线性关系一致性较好,未发现异位、倒位的现象。然后对两菌株的蛋白质序列使用OrthoVenn2进行差异比较,结果如图7所示,两株菌共有的核心基因3 891个,AM1特有基因115个,NI91特有基因42个。对NI91和AM1特有基因进行GO分类统计,如图8所示,NI91相对于AM1特有的基因主要是生物学过程(biological process);如图9所示,AM1相对于NI91所特有的基因仅有生物学过程和分子功能(molecular function)且以生物学过程(cellular metabolic process)的基因居多,没有细胞定位(cellular component)特有的基因。