《表1 35株ASFV全基因组统计信息》

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《35株非洲猪瘟病毒全基因组序列的系统生物学分析》


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通过NCBI获得40多种非洲猪瘟的全基因组数据,对这些数据中未验证的数据进行剔除,最终得到35种基因组数据、基因型信息(表1)[12-15]。使用MAFFT、MEGA软件比对、构建系统进化树,描述35种不同基因组数据之间的关系。并结合对ASFV基因型研究,绘制进化树和基因分型关系图(图1),发现亚洲地区与欧洲地区病毒基因型相同,并且与使用全基因构建进化树分类一致。在进化树中出现最早的病毒可能是马拉维Ⅷ基因型,同时Ⅰ与Ⅳ基因型在全基因组层面上具有一定的相似性。