《表3 RABV广西流行株全基因组序列的长度比较(bp)》
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《2000—2019年广西狂犬病病毒流行株的基因组遗传稳定性分析》
从NCBI下载2000—2019年RABV广西流行株的全基因组序列,运用MegAlign进行同源性比对分析,结果发现不同RABV广西流行株间的核苷酸序列同源性在87.1%~99.1%,其中GXSL2018株和GXYZ2018株的同源性为99.4%(图1)。9株RABV广西流行株的基因组序列全长为11921~11924 bp(表3),其主要区别在于P-M间隔区和5'-UTR,P-M间隔区多为87 bp(6株),只有3株毒株为86 bp,5'-UTR多为130或131 bp,但LB19株的5'-UTR为129 bp。2018年分离获得的GXSL2018株和GXYZ2018株全基因组序列均为11923 bp,与其他RABV广西流行株相比,其主要差异是这2株毒株的3'-UTR为69 bp,且在第20位缺失一个核苷酸(图2)。综上所述,近20年来广西的RABV流行株非常保守,其遗传特性稳定。
图表编号 | XD00156684100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.01 |
作者 | 覃晴、梁星雪、曹晗、韦显凯、梁晶晶、李晓宁、罗廷荣 |
绘制单位 | 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学动物科学技术学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学动物科学技术学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学动物科学技术学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学动物科学技术学院、广西动物疫病预防控制中心、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学动物科学技术学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学动物科学技术学院、亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室、广西大学动物科学技术 |
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