《表6 DNAstar在线软件对NOS1AP基因翻译的氨基酸序列的预测》

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《NOS1AP基因非编码区位点多态性与精神分裂症的关联研究》


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NOS1AP蛋白、主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)-Ⅰ复合物和MHC-Ⅱ复合物在中枢神经系统神经元生长和发育中发挥重要作用。NOS1AP蛋白对于MHC分子结合配体发挥重要衔接作用。蛋白质二级结构预测软件发现rs12742393位点为A碱基时,其编码的MHC-Ⅰ复合物和MHC-Ⅱ复合物配体结合区域α1结合NOS1AP蛋白第50位氨基酸为色氨酸;当为C碱基时,MHC-Ⅰ复合物和MHC-Ⅱ复合物配体结合区域α1结合NOS1AP蛋白第50位氨基酸为丙氨酸(表6)。氨基酸的不同可能会影响MHC复合物与受体结合的亲和力。二级结构空间构象的组成比例:A碱基时,α螺旋17.02%,β折叠28.72%,β转角88.51%,无规卷曲45.74%;C碱基时,α螺旋15.96%,β折叠30.85%,β转角8.51%,无规卷曲44.68%。蛋白质二级结构的空间构象主要依靠α螺旋的氢键的作用力。当NOS1AP基因rs12742393位点为C碱基时,α螺旋比例下降,从而导致蛋白质二级结构稳定性下降。因此,软件预测发现NOS1AP位点多态性会影响其RNA和蛋白质二级结构的稳定性以及MHC复合物与配体结合的亲和力。