《表1 DNAStar预测得到的CM16的线性B细胞表位》
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《小麦主要过敏原CM16线性B细胞表位的预测及初步鉴定》
一般认为,亲水性和表面可及性高的区域易分布在蛋白质分子的表面,且柔性区域易于发生折叠和扭曲,容易产生表位与抗体结合[20]。如图2所示,在氨基酸亲水性分析中,亲水性指数大于0表明亲水性好,CM16的亲水性区域分布较为均匀,其中亲水性较高的区域分别为AA 88~100和AA 137~143。在可塑性分析中,发现AA 26~32、AA 39~51、AA 54~62、AA 64~67、AA 75~78、AA 89~98、AA 103~108、AA 130~132和AA 138~140区域具有一定的柔性,容易发生折叠、弯曲,易与抗体结合。在抗原指数分析中,以抗原指数大于0为筛选条件,结果显示抗原指数较高的区域为AA 26~34、AA 42~63、AA 66~70、AA 71~84、AA 88~99、AA 100~111和AA 137~143,可能含有潜在的优势抗原表位。最后对于CM16的表面可及性进行了分析,表面可及性指数大于1为筛选条件,结果显示AA 47~50、AA 58~60、AA 62~65、AA 90~96和AA 138~143区域具有较好的表面可及性。综合以上各参数,将同时满足4个参数筛选条件的表位预测为CM16可能的线性B细胞表位,如表1所示。
图表编号 | XD00123443600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.25 |
作者 | 李雪娇、李欣芮、范卓妍、张亚妮、车会莲 |
绘制单位 | 北京食品营养与人类健康高精尖创新中心中国农业大学食品科学与营养工程学院、北京食品营养与人类健康高精尖创新中心中国农业大学食品科学与营养工程学院、北京食品营养与人类健康高精尖创新中心中国农业大学食品科学与营养工程学院、北京食品营养与人类健康高精尖创新中心中国农业大学食品科学与营养工程学院、北京食品营养与人类健康高精尖创新中心中国农业大学食品科学与营养工程学院 |
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