《表1 DNAStar预测得到的CM16的线性B细胞表位》

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《小麦主要过敏原CM16线性B细胞表位的预测及初步鉴定》


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一般认为,亲水性和表面可及性高的区域易分布在蛋白质分子的表面,且柔性区域易于发生折叠和扭曲,容易产生表位与抗体结合[20]。如图2所示,在氨基酸亲水性分析中,亲水性指数大于0表明亲水性好,CM16的亲水性区域分布较为均匀,其中亲水性较高的区域分别为AA 88~100和AA 137~143。在可塑性分析中,发现AA 26~32、AA 39~51、AA 54~62、AA 64~67、AA 75~78、AA 89~98、AA 103~108、AA 130~132和AA 138~140区域具有一定的柔性,容易发生折叠、弯曲,易与抗体结合。在抗原指数分析中,以抗原指数大于0为筛选条件,结果显示抗原指数较高的区域为AA 26~34、AA 42~63、AA 66~70、AA 71~84、AA 88~99、AA 100~111和AA 137~143,可能含有潜在的优势抗原表位。最后对于CM16的表面可及性进行了分析,表面可及性指数大于1为筛选条件,结果显示AA 47~50、AA 58~60、AA 62~65、AA 90~96和AA 138~143区域具有较好的表面可及性。综合以上各参数,将同时满足4个参数筛选条件的表位预测为CM16可能的线性B细胞表位,如表1所示。