《表1 N蛋白B细胞表位预测》

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《一株抗猪流行性腹泻病毒N蛋白单克隆抗体抗原表位的鉴定》

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注:红色字体为包含关键氨基酸的B细胞表位Notes:The B cell epitopes containing key amino acids are shown in red

本研究利用Kolaskar和Tongaonka所报道的方法预测N蛋白的B细胞表位，结果显示该肽段可能含有13个B细胞表位（表1）。其中3号肽段71SNWHFYYLGT80包含了虚拟表位中的关键氨基酸。由于噬菌体显示的肽段并不能代表9G11在N蛋白真正的表位，本研究人工合成了包含FYYL的N蛋白片段pep（70PSNWHFYYLGTG81）、FYYL被随机替换成S蛋白片段的pepΔFYYL（70PSNWHYKMAGTG81）和无关的肽段pepran（DANYWWDLTSTQ）。包被的合成多肽与9G11进行ELISA实验，结果显示只有70PSNWHFYYL-GTG81与9G11发生特异性结合，而pepΔFYYL和无关的肽段pepran都不与单抗结合，且呈现极显著差异，表明FYYL是识别9G11的关键氨基酸（图5）。