《表1 EV71和CVA16线性表位的预测结果》

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《人肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型B细胞线性表位的生物信息学预测》

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注:a线性表位预测结果用肽段在结构蛋白上的位置指示；b4E8为文献中的抗体名称，其余均为文献命名的表位名称.

EV71和CVA16线性表位的预测结果见表1和图1.图1中氨基酸序列上方的圆和下方的五角星分别代表了EV71和CVA16的预测结果（预测表位）.16个预测表位中，6个分布在VP1上，7个分布在VP3上，只有3个分布在VP2上.进一步对比EV71和CVA16的线性表位可以发现，线性表位的分布具有2个重要特征:（1）首先线性表位的分布具有二级结构偏好性，大多数的线性表位都分布在环上（13/16，81.3%）；其次是C-末端（2/16，12.5%）和N-端（1/16，6.3%）；也可以反过来理解，超过半数环都能够成为表位（13/21，61.9%），3个C-末端中有2个（VP1和VP3）分布了表位，而没有分布表位的VP2几乎没有C-末端；N-末端未暴露在衣壳表面，所以相对不易形成表位.（2）绝大多数EV71的线性表位在结构蛋白上的位置与CVA16高度一致，但肽段的保守性（VP1、VP2和VP3分别为66.7%、67.4%和76.1%）比环的保守性还低.16个预测表位中，没有1个表位完全保守，其中12个（75%）表位含有至少3个氨基酸突变，这提示大多数的表位可能具有血清型特异性.